اتم، ماموریتش تقویت فضای حل مساله در کشور است. به واسطه شناسایی نوآوران اجتماعی که در موقعیت های خرد محلی، خلاقانه مساله بوم خود را حل کردهاند. از این منظر، نقشه کشور پر است از نقطههای توپور پررنگ ریزی که کل پهنه ایران را پر کردهاند. کار اتم شناسایی این نقطههاست، در وهله اول. و در مرحله بعد ترسیم خطوط ممتد، متعدد و متراکم بین این نقطهها. یعنی تقویت شبکه اتمها. و در اثنای این دو مرحله، تقویت فعالیت اتمها.
بنیاد اتم مجموعهای است که به کار شناسایی، تکثیر و آموزش کنشگران اجتماعی میپردازد؛ کنشگران اجتماعی که در این مجموعه به نام اتم شناخته میشوند، الگوها و تجربههای موفق مردمی هستند که همواره دغدغه حل مشکلات اطراف خود را دارند. آنها در وهله اول با مسئلهیابی و بعد با خلاقیت، نوآوری و جذب مشارکت مردمی برای حل مشکلات اطراف خود چارهجویی میکنند. بنیاد اتم این ماموریت را برای خود تعریف کرده است که با شناسایی دقیق این افراد و تکثیر ایده آنها، اتم بودن را به یک فرهنگ در سطح جامعه تبدیل کند؛ چراکه بنیاد اتم معتقد است تنها با تجمیع این الگوها و تجربههای موفق مردمی است که میتوان به تغییر در جامعه امید داشت.